对口支援新疆的大学名单如下：
1. 清华大学
2. 西安交通大学
3. 武汉大学
4. 中南大学
5. 中国人民大学
6. 北京师范大学
7. 大连理工大学
8. 同济大学
9. 北京外国语大学
10. 东华大学
11. 中国矿业大学
12. 中山大学
13. 东北师范大学
14. 厦门大学
15. 四川大学
16. 电子科技大学
17. 浙江大学
18. 南京农业大学
19. 西北农林科技大学
20. 北京林业大学
21. 华北电力大学
22. 河海大学
23. 江南大学
24. 合肥工业大学
25. 中国海洋大学
26. 中央财经大学
27. 中南财经政法大学
28. 西南财经大学
29. 东北林业大学
30. 山东大学
31. 陕西师范大学
32. 西南大学
33. 湖北大学
34. 武汉科技大学
35. 湖北工业大学
36. 武汉工程大学
37. 长江大学
38. 三峡大学
39. 河北师范大学
40. 河北科技大学
41. 石家庄铁路职业技术学院
这些高校通过不同的合作协议和框架，为新疆的各所高校提供支持和帮助，以促进新疆高等教育的发展和提升。