自动化专业的二本大学排名如下：
天津科技大学（理科）
重庆理工大学（理科）
青岛理工大学（理科）
南京工程学院
中南民族大学
南昌航空大学
长春工业大学
沈阳工程学院
河南理工大学
哈尔滨理工大学
沈阳工业大学
上海电力学院
上海海事学院
北方工业大学
辽宁工程技术大学
兰州理工大学
湖北工业大学
三峡大学
西安工业大学
东北师范大学
哈尔滨工程大学
东北电力大学
东北林业大学
北京信息科技大学
北京电子科技职业学院
北京石油化工学院
上海电机学院
吉林化工学院
华北水利水电大学
齐齐哈尔大学
建议：
天津科技大学、 重庆理工大学和 青岛理工大学在自动化专业的理科排名中位列前三，是理科生报考的热门选择。
南京工程学院在多个排名中均表现较好，适合文科生报考。
沈阳工程学院和 河南理工大学也是值得考虑的选项，特别是在辽宁省内。
请根据个人兴趣、学科偏好及地理位置等因素，综合考虑以上排名信息，选择最适合自己的学校。