理科二本大学的专业目录主要包括以下几类：
数学类
数学与应用数学
信息与计算科学
数理基础科学
数据计算及应用
物理学类
物理学
应用物理学
核物理
量子信息科学
化学类
化学
应用化学
化学测量学与技术
化学生物学
资源化学
分子科学与工程
天文学类
天文学
地理科学类
地理科学
自然地理与资源环境
人文地理与城乡规划
地理信息科学
大气科学类
大气科学
应用气象学
海洋科学类
海洋科学
海洋技术
地球物理学类
地球物理学
空间科学与技术
地质学类
地质学
地球化学
生物科学类
生物科学
生物技术
生物信息学
生态学
心理学类
心理学
应用心理学
统计学类
统计学
应用统计学
工学类（部分偏理科）：
机械工程及其自动化
电气工程及其自动化
计算机科学与技术
电子信息工程
软件工程
土木工程
水利水电工程
车辆工程
船舶电子电气工程
医学类（部分专业偏理科）：
临床医学
基础医学
口腔医学
预防医学
这些专业涵盖了理学、工学、农学和医学等多个学科门类，为理科生提供了广泛的选择。建议学生在选择专业时，结合自己的兴趣和职业规划，选择最适合自己的方向。