日本公立医学大学的排名如下：
S级国立大学（医学部）
东京大学医学部
特色：脑科世界闻名，基于临床医学训练临床医生。
数据：年度偏差值约75.0，国家医师考试合格率91%。
京都大学医学部
特色：多功能干细胞研究所，山中伸弥教授获诺贝尔生理学或医学奖。
数据：偏差值约76.5，国家医师考试合格率88%。
大阪大学医学部
特色：与全球资深临床医生和研究人员合作，提供临床诊断和治疗经验。
A级国立大学（医学部）
东北大学医学部
特色：医学科学系和健康科学系，提供医学博士-博士课程。
九州大学医学部
特色：培训医生、卫生保健专业人员和研究人员。
筑波大学医学部
特色：未提供详细信息。
神户大学医学部
特色：未提供详细信息。
北海道大学医学部
特色：未提供详细信息。
名古屋大学医学部
特色：未提供详细信息。
广岛大学医学部
特色：未提供详细信息。
千叶大学医学部
特色：未提供详细信息。
东京慈惠会医科大学
特色：未提供详细信息。
B级国立大学（医学部）
金泽大学医学部
特色：未提供详细信息。
冈山大学医学部
特色：未提供详细信息。
大阪市立大学医学部
特色：未提供详细信息。
信州大学
特色：未提供详细信息。
山梨大学
特色：未提供详细信息。
横滨市立大学医学部
特色：未提供详细信息。
山形大学
特色：未提供详细信息。
京都府立医科大学医学部
特色：未提供详细信息。
爱媛大学
特色：未提供详细信息。
熊本大学医学部
特色：未提供详细信息。
香川大学
特色：未提供详细信息。
高知大学
特色：未提供详细信息。
佐贺大学
特色：未提供详细信息。
滋贺医科大学
特色：未提供详细信息。
岐阜大学
特色：未提供详细信息。
鹿儿岛大学
特色：未提供详细信息。
新泻大学
特色：未提供详细信息。
秋田大学
特色：未提供详细信息。
31. 大分大学
特色：未提供详细信息。
32. 长崎大学
特色：未提供详细信息。
33. 鸟取大学
特色：未提供详细信息。
34. 岛根大学
特色：未提供详细信息。
35. 富山大学
特色：未提供详细信息。
36. 福井大学
特色：未提供详细信息。
37. 札幌医科大学
特色：未提供详细信息。
38. 琉球大学
特色：未提供详细信息。
39. 三重大学
特色：未提供详细信息。
40. 滨松医科大学
特色：未提供详细信息。
41. 弘前大学
特色：未提供详细信息。
42. 山口大学
特色：未提供详细信息。
43. 群马大学
特色：未提供详细信息。
44. 宫崎大学