军中最难考的二本大学有以下几所：
国防科技大学
国防科技大学是军校中唯一的985、211大学，录取条件非常严格，不仅要求分数高，对身体素质的要求也很高。虽然录取难度极大，但只要考进去，毕业后的工资非常诱人。
外交学院
外交学院直属于中国外交部，是我国外交部唯一直属的全国重点大学，有“中国外交官摇篮”的美称。专业以外交外事、国际问题研究、对外经济等为中心，录取难度也较高，需要过硬的实力。
上海海关学院
上海海关学院前身为1953年创建的上海海关学校，现直属于中华人民共和国海关总署。该学院的特色是准军事化管理，录取难度也较高，每年的录取分数线要超过一本录取分数线很多分。
上海立信会计金融学院
上海立信会计金融学院是由原上海立信会计学院和原上海金融学院合并组建而成，金融学专业在银行系统认可度较高。虽然学院位置较偏，但整体环境和设施都很不错，录取难度也较大。
成都医学院
成都医学院创办于1947年，2004年正式改名为成都医学院。学校坐落于四川省成都市，虽然是一所二本大学，但录取难度也相对较高。
陆军炮兵防空学院
陆军炮兵防空学院对同学们来说是个不错的选择，就业有保障，分数要求在所有军校中也算偏低，一般在一本线上下。
空军工程大学
空军工程大学的录取分数线一般在486分上下，算是军校中录取分数最低的，相对来说是也最容易考上的军校。
综合来看，国防科技大学和外交学院由于其极高的知名度和严格的录取条件，是军中最难考的二本大学。上海海关学院、上海立信会计金融学院、成都医学院虽然录取难度也较高，但相对于国防科技大学和外交学院来说，难度稍低一些。陆军炮兵防空学院和空军工程大学相对容易一些，适合分数在一本线附近的学生报考。