福建二本大学的院校代码如下：
1. 厦门大学：3501
2. 华侨大学：3502
3. 福建农林大学：3503
4. 集美大学：3504
5. 福州大学：3505
6. 仰恩大学：3506
7. 福建医科大学：3507
8. 福建师范大学：3508
9. 福建工程学院：3509
10. 福建中医学院：3510
11. 泉州师范学院：3511
12. 漳州师范学院：3512
13. 闽江学院：3513
14. 莆田学院：3514
15. 三明高等专科学校：3515
16. 宁德师范高等专科学校：3516
17. 龙岩师范高等专科学校：3517
建议：
院校代码可能会有变动，建议考生在填报志愿前，查阅福建省教育考试院最新公布的信息，以确保信息的准确性。
填报高考志愿时，除了院校代码，还要关注专业的代码，以确保能准确选择自己感兴趣的专业。