耶拿大学在不同排名系统中的位置有所差异，但总体来说，耶拿大学在世界大学排名中通常位于前500名之内。根据最近的数据，耶拿大学在QS世界大学排名中位于第344名，在US NEWS世界大学排名中位于第395名，在TIMES世界大学排名中位于第251名，在ARWU世界大学学术排名中位于第401名。这些排名显示了耶拿大学在多个学科领域，如物理学、化学、生物学、哲学等，都有不错的表现。
需要注意的是，排名结果可能会随着不同排名机构和评价标准的变化而有所变动。耶拿大学在某些排名中可能表现不如其他一些国际知名的大学，但这并不意味着它的教育质量不高。排名只是衡量大学多方面表现的一个参考指标，选择大学时还应考虑其他因素，如专业特色、教学质量、研究设施等