理科超一本40分可以考虑报考以下大学：
清华大学 和 北京大学：
这两所大学在国内外享有很高的声誉，在理科领域也有很强的研究实力和招生。
复旦大学：
这所大学在国内理科教育领域也有很高的知名度和声誉，对考生的分数线要求相对较低。
上海交通大学：
这所大学在国内理科教育领域和科研领域都有很高的知名度和声誉，招生也相对稳定。
哈尔滨工程大学、 北京化工大学、 武汉理工大学、 中国矿业大学、 西北大学、 中国石油大学（华东）、 长安大学、 大连海事大学、 河北工业大学：
这些大学都是国内重点大学，理科生超过一本线40分可以选择性报考。
郑州大学、 河南大学：
这些大学也是国内重点大学，适合理科超一本40分的考生报考。
合肥工业大学、 安徽大学、 安徽师范大学、 安徽农业大学、 蚌埠医学院、 安徽警官学院：
这些大学在安徽省内具有较高知名度，适合理科超一本40分的考生报考。
重庆邮电大学、 重庆交通大学、 成都信息工程大学：
这些大学在理科领域也有一定的招生名额，适合理科超一本40分的考生报考。
福州大学：
这所大学是211工程高校，双一流建设高校，工科见长，适合理科超一本40分的考生报考。
江西财经大学、 江西师范大学、 景德镇陶瓷大学、 江西中医药大学、 江西科技师范大学、 赣南医学院、 江西理工大学、 井冈山大学、 江西农业大学、 江西科技学院、 宜春学院、 赣南师范大学、 景德镇学院、 萍乡学院、 上饶师范学院：
这些大学在江西省内具有一定的知名度，适合理科超一本40分的考生报考。
建议考生根据自身的专业兴趣、地理位置偏好以及未来的职业规划，综合考虑这些大学的录取情况和专业特色，选择最适合自己的学校。同时，建议多关注各个高校的招生简章和录取分数线，以便做出更为明智的决策。