南通医科大学在多数省份被视为一本院校。具体而言，在山西、内蒙古、吉林、黑龙江、江苏、浙江、安徽、江西、河南、湖北、湖南、贵州、宁夏、新疆等省份，南通医科大学被归为本科一批招生录取，因此在这些省份它是一本院校。然而，在北京、天津、河北、辽宁、上海、福建、山东、广东等地，南通医科大学则属于本科批录取，因此在这些地区它被视为本科院校。
此外，虽然南通大学整体被认定为二本院校，但其医学专业如临床医学等通常被认为是一本专业，且录取分数线较高。
综上所述，南通医科大学在多数省份被视为一本院校，具体是否为一本院校还需参考各省份的招生录取批次信息。