民办大学的论文审查流程一般包括以下几个步骤：
初审
对论文的基础结构、内容和语言进行初步审核，判断是否满足学校所制定的论文格式要求。
通过初审的论文将被提交到查重系统中进行查重。
查重
使用查重系统检测论文是否存在抄袭现象。
学校通常会购买一些正版的查重软件，比如知网、维普、PaperFree等，这些软件具有很好的查重能力和自动分析能力。
复审
由多方面的专业人员（如教师和论文评审员）对查重结果及论文本身进行审核。
复审人员会根据查重结果以及自己的专业知识和经验，对论文进行复审，判断论文是否真正达到了学术论文的标准。
终审
学校审核组对已经通过初审和复审的论文进行最后的审核、签字、盖章，并进行书面公示。
终审是论文审核流程的最后环节，如果论文没有通过终审，则该论文将被视为无效，无法获得毕业证书。
此外，论文审查还可能包括以下方面：
政治性审查
主要审查论文是否涉及国家领土和主权问题、民族尊严问题、党的方针和政策问题、涉外问题、宗教问题、历史问题、保密问题等。
创新性审查
评估论文的创新性，是否符合学术要求。
内容审查
检查论文的内容是否符合毕业学位要求，是否过于夸张离谱。
综上所述，民办大学的论文审查是一个严谨的过程，涵盖了从初步审核到最终审核的多个环节，旨在确保学术诚信和学术质量。学生需要认真对待论文的撰写和审查过程，以确保论文能够顺利通过审核并获得相应的学位。