厦门的优质二本大学排名如下：
厦门理工学院
主管部门：福建省
所在地：厦门市
办学层次：本科
备注：福建省重点建设高校、福建省一流学科建设高校、福建省闽台高校联合培养人才项目试点高校、全国深化创新创业教育改革示范高校、中国政府奖学金委托培养院校、厦门市陈嘉庚奖学金合作高校，入选服务国家特殊需求人才培养项目、卓越工程师教育培养计划、新工科研究与实践项目、“十三五”应用型本科产教融合发展工程。
厦门医学院
主管部门：福建省
所在地：厦门市
办学层次：本科
备注：全日制公办普通本科高校，是福建省三所医学类本科高校之一，也是闽西南唯一的医学类本科高校。设有医学、药学、口腔医学、护理、基础医学等多个学院和研究院。
厦门华厦学院
主管部门：福建省教育厅
所在地：厦门市
办学层次：本科
备注：民办应用型本科院校，学校创建于1993年，时为私立厦门华厦大学。2015年4月28日正式批准设立。
厦门工学院
主管部门：福建省教育厅
所在地：厦门市
办学层次：本科
备注：民办全日制普通本科院校，前身为华侨大学厦门工学院。设有工学、理学、文学、经济学、管理学等九个二级学院。
集美大学诚毅学院
主管部门：福建省教育厅
所在地：厦门市
办学层次：本科
备注：民办高校，校园占地面积550多亩，建筑面积408893平方米，设有教学院系12个，开办本科专业37个。有专任教师700多人，在校生近15000人。
建议：
厦门理工学院和 厦门医学院在福建省乃至全国都有较高的知名度和学术实力，是厦门地区二本大学中的佼佼者。
厦门华厦学院和 厦门工学院作为民办高校，虽然办学时间相对较短，但在应用型人才培养方面表现突出，得到了社会的认可。
集美大学诚毅学院作为集美大学的一部分，拥有较好的教学资源和师资力量，也是值得考虑的二本院校之一。