杭州的民办大学主要被视为三本院校。以下是具体的院校名单和相关信息：
浙江树人大学 浙大城市学院
杭州电子科技大学信息工程学院
浙江理工大学
浙江工商大学（其民办三本为杭州商学院）
此外，虽然有些院校在某些排名或分类中可能被视为二本，但根据目前可靠的信息来源，这些院校主要被认为是三本院校。
因此，如果你打算申请杭州的民办大学，建议主要关注这些三本院校，并确保你的分数符合这些学校的录取要求。
建议：
在选择民办大学时，除了考虑学校的批次外，还要综合考虑学校的教学质量、专业设置、地理位置等因素，以确保选择到最适合自己的学校。