在日本，高等教育机构并没有“一本、二本、三本”的划分方式。这种分类方法主要适用于中国，用于描述不同层次和类型的大学。在日本，大学主要被划分为国立、公立和私立三种类型。
国立大学：
这些大学是由日本国家政府直接设置的，由国家全额出资建立。它们通常拥有较高的学术水平和研究实力，包括一些国内和国际上都非常知名的大学，如东京大学、京都大学、大阪大学等。
公立大学：
这些大学是由地方政府出资设置的。虽然它们的学术水平和研究实力可能不如国立大学，但在当地或特定领域仍有一定的知名度和影响力。
私立大学：
这些大学是由民间资本所维持经营的。私立大学的数量众多，学术水平和声誉参差不齐，有些学校在某些专业或领域可能具有特色和优势。私立大学包括一些知名的私立学府，如早稻田大学、庆应义塾大学等。
因此，如果你正在考虑申请日本的大学院，建议关注这些不同类型的大学，并根据自己的学术背景、研究兴趣和职业目标来选择最适合自己的学校。