日本的高等教育体系与中国的高等教育体系是不同的。在日本，大学分为国立、公立和私立三种类型，并没有“二本”这样的分类。日本的高等教育体系中，并没有将大学分为“一本”和“二本”的层次，而是根据各个大学的特色和实力进行排名和分类。
在中国，高等教育体系分为本科和专科，其中本科教育又分为一本、二本和三本等不同层次。二本大学通常指的是第二批次录取的本科院校，其录取分数线低于一本院校，但高于三本院校。
因此，提到“日本为什么是二本大学”的问题，实际上是一个基于错误前提的问题。日本没有“二本”的大学，它的大学体系与中国是不同的。