在二本交通大学中，最好的学校可以从以下几个方面进行考虑：
全国排名
南州交通大学：全国排名第150位。
华东交通大学：全国排名第191位。
大连交通大学：全国排名第240位。
石家庄铁道大学：全国重点大学，与河北省政府共建，以铁路相关专业著称。
兰州交通大学：是国家铁路集团有限公司与甘肃省人民政府共建高校，以铁路相关专业为主。
专业特色
华东交通大学：以交通为特色，轨道为核心，多学科协调发展，优势专业包括控制科学与工程、交通运输工程、电气工程及其自动化等。
大连交通大学：机械工程、材料科学与工程等学科实力较强，教学质量高，地处交通枢纽城市，为学生提供众多就业机会。
山东交通学院：与多个国家的高校有合作关系，提供丰富的实习机会，专业包括交通运输、车辆工程、机械设计制造及其自动化等。
石家庄铁道大学：以铁路相关专业著称，如土木工程、铁道工程等。
兰州交通大学：以轨道交通为核心，学科专业建设突出，尤其是在交通运输、机械工程、土木工程等领域具有明显优势。
地理位置
华东交通大学：位于江西省南昌市，有利于江西省内学生就读和就业。
大连交通大学：位于辽宁省大连市，地处交通枢纽城市，有利于学生获取实践机会和就业机会。
山东交通学院：位于江苏省，有利于江苏省内学生就读和就业。
石家庄铁道大学：位于河北省石家庄市，有利于河北省内学生就读和就业。
兰州交通大学：位于甘肃省兰州市，有利于甘肃省内学生就读和就业。
综合以上信息，可以得出以下结论：
南州交通大学在全国排名中位列前茅，工程类专业尤其是交通、土木、建筑等领域具有较强的优势，实践教学基地和企业合作关系紧密，毕业生就业率较高，是二本交通大学中较好的选择。
华东交通大学在全国排名第191位，以交通为特色，轨道为核心，多学科协调发展，优势专业包括控制科学与工程、交通运输工程、电气工程及其自动化等，毕业生在江西省交通行业中的就业前景良好。
大连交通大学在全国排名第240位，机械工程、材料科学与工程等学科实力较强，教学质量高，地处交通枢纽城市，为学生提供众多就业机会。
山东交通学院与多个国家的高校有合作关系，提供丰富的实习机会，专业设置符合交通行业需求，是一所具有较高声誉的交通院校。
石家庄铁道大学和 兰州交通大学分别以铁路相关专业著称，具有明显的学科优势，适合对铁路行业有兴趣的学生。
建议根据个人兴趣、专业偏好及地域选择合适的交通大学。如果对交通行业有浓厚兴趣，且希望在江西省内就业，华东交通大学是一个不错的选择。如果希望获取更多的实践机会和就业机会，大连交通大学和山东交通学院也较为推荐。对于立志于铁路行业的学生，石家庄铁道大学和兰州交通大学则是值得考虑的院校。