关于“第二医科大学是一本吗”的问题，存在以下两种观点：
上海第二医科大学
上海第二医科大学在1997年通过了211工程建设项目立项评审，是国家211工程重点建设院校，因此被认为是 一本大学。
山东第二医科大学
山东第二医科大学在不同省份的招生批次有所不同。在青海，山东第二医科大学实行本科一批次招生，因此被认为是 一本大学。然而，在山西、山东等其他省份，山东第二医科大学是按照本科二批进行招生的，因此也可以被认为是 二本大学。
新疆第二医学院
新疆第二医学院在全国基本是本科二批招生，因此通常被认为是 二本大学。
综上所述，上海第二医科大学可以被认为是 一本大学，而山东第二医科大学和新疆第二医学院则根据具体省份的招生批次，分别被认为是 一本或 二本大学。