在安徽省，二本医科高校包括以下几所：
安徽医科大学：
安徽医科大学是安徽省办学历史最早的高等学校之一，是安徽省第一所高等医科院校。学校坐落在合肥市，承立德树人之使命，育精医报国之英才。
皖南医学院：
皖南医学院地处芜湖市，濒临浩瀚长江，汇集江南神秀。学校以医学类专业为主，尤其是临床医学、药理学与毒理学等，具有较高的教学水平和科研实力。
蚌埠医学院：
蚌埠医学院位于蚌埠市，是安徽省省属普通高等医学院校，是国家首批具有学士和硕士学位授予权单位、国家首批卓越医生教育培养计划试点高校、国家首批大学生创新创业训练计划试点高校。学校的医学教育资源丰富，教学和科研水平较高。
安徽医科大学临床医学院：
虽然目前在安徽省还是第三批次招生，但随着全国二本三本迅速合并，因此无需在乎二本三本，其教学水平不亚于上述三所高校，还是值得考虑的。
综上所述，安徽医科大学的二本院校包括安徽医科大学、皖南医学院、蚌埠医学院和安徽医科大学临床医学院。建议根据个人兴趣、专业优势和职业规划，选择合适的院校进行报考。