二本大学与清华大学和北京大学之间存在明显的差距。清华大学和北京大学是中国最顶尖的高等教育机构，拥有极高的科研水平和师资力量，其学科评估成绩和排名均位列全国前列。而二本大学在师资力量、学生水平、科研能力等方面通常无法与这两所顶尖高校相比。
具体来看，清华大学和北京大学在第四次学科评估中均斩获了21个A+学科，数量并列全国第一。清华大学的工学学科共有20个学科获得A类评价，其中14个学科获评A+，在建筑、能源、信息、材料、环境等传统优势工科方面态势良好。北京大学在文思哲、理工科方面都表现突出，但并非所有参评学科都拿到了A+，其戏剧与影视学学科在全国排名较低。
相比之下，二本大学如成都医学院、徐州医科大学、华北理工大学、鲁东大学等，虽然在某些学科或专业上表现优秀，如烧伤整形外科、消化内科、药学、护理学、检验医学、冶金工程、临床医学等，但这些学校整体实力与清华大学和北京大学相比仍有较大差距。这些二本大学在科研水平、师资力量、教育资源等方面通常无法与顶尖高校相媲美，因此在学术声誉、就业前景等方面也可能存在一定的局限性。
综上所述，二本大学与清华大学和北京大学之间存在明显的差距，无论是在学科评估成绩、师资力量还是教育资源等方面，二本大学通常无法与这两所顶尖高校相比。如果学生在选择高校时，应优先考虑清华大学和北京大学等顶尖学府，以获得更好的教育和科研机会。