上海微生物大学排名如下：
复旦大学
武汉大学
中山大学
中国科学技术大学
华中农业大学
中国农业大学
山东大学
南开大学
云南大学
浙江大学
上海交通大学
建议：
复旦大学在微生物学专业中排名第一，显示出其在这一领域的较强实力。
其他高校如武汉大学、中山大学、中国科学技术大学等也表现优异，排名靠前。
如果考虑在上海地区的大学，上海科技大学、上海师范大学和华东师范大学在生物科学专业中表现较好，但具体排名未提及微生物学专业。
这些排名信息基于2017年的数据，实际情况可能会有所不同。建议进一步查找最新的排名信息以获得最准确的答案。