日本在病毒学研究方面拥有多所著名的大学，以下是部分日本大学在病毒学领域的排名和研究方向：
东京大学
农学生命科学研究科-兽医微生物学研究室
研究课题：D型流感病毒、禽流感病毒等病毒学研究、蝙蝠中发现的新型病毒。
医科学研究所-病毒感染研究室
研究课题：以流感病毒与埃博拉病毒为例，研究病毒与宿主在分子、细胞、个体以及群体层面间的动态相互作用。
筑波大学
医学医疗系-分子病毒学研究室
研究课题：病毒基因组的复制与宿主特异性、病毒基因组的运输与粒子形成、上皮细胞的特异性炎症响应、抗病毒药的研发等。
大阪大学
医学系研究科-病毒学研究室
以上信息基于2020年的数据，排名不分先后。这些研究室的研究方向涵盖了从病毒基因组学、分子病毒学、到兽医微生物学等多个领域，体现了日本在病毒学研究方面的全面性和深度。
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