真空专业在中国的大学排名中，合肥工业大学（合工大）和东北大学（东大）是开设该专业的两所主要学校。根据提供的信息：
开设时间和毕业人数
合工大在开设真空专业的时间上位于第二，但在每年毕业的人数上位居第一。
专业应用领域
真空专业应用领域广泛，合肥工业大学和东北工业大学的真空专业毕业生在工业应用方面具有一定的优势。
专业实力对比
东北大学位于东三省，偏向于真空镀膜，工业应用方面实力较强。
合肥工业大学位于安徽，与科学岛上的中科院研究所以及中国科学技术大学合作广泛，在系统研制与设计以及实验室真空装备方面实力突出。
根据上述信息，可以得出结论，合肥工业大学和东北大学在真空专业方面都有各自的优势和特色。若要选择排名，合肥工业大学在毕业人数上可能更具优势，而东北大学在工业应用方面可能更为突出。