北京大学
清华大学
上海交通大学
中国科学技术大学
武汉大学
中国农业大学
南京大学
复旦大学
浙江大学
华中农业大学
南开大学
东北师范大学
中山大学
四川大学
首都医科大学
北京师范大学
江南大学
云南大学
山东大学
南京农业大学
建议：
北京大学、 清华大学和 上海交通大学在微生物学专业的排名中一直位居前列，这三所学校在微生物学领域具有极高的声誉和科研实力，是考研的理想选择。
中国科学技术大学、 武汉大学、 中国农业大学等也是微生物学专业考研的热门学校，各有其特色和优势。
江南大学、 云南大学和 山东大学等学校在微生物发酵、放线菌研究等方面具有显著优势，也值得考虑。
这些排名综合了不同来源的数据，建议结合自己的兴趣和研究方向，仔细考察各学校的具体情况和师资力量，选择最适合自己的学校。