京都精华大学
京都精华大学被誉为日本乃至全球第一所设立漫画专业的大学，也是日本第一所加入CUMULUS（国际设计艺术院校联盟）的大学。该校在漫画专业的研究和创作方面具有极高的声誉，2010年创立了日本第一个漫画研究科，专注于漫画的理论与创作研究。
东京艺术大学
东京艺术大学是日本顶尖的艺术学府，其映像研究科下的动画专业分为平面动画、立体动画、企划制作和研究与理论等多个研究方向。学院师资力量雄厚，包括奥斯卡最佳动画短片提名的大师山村浩二。
武藏野美术大学
武藏野美术大学的动画专业隶属于造型学部的映像学科，注重动画与其他影像形式的跨界，如电影、漫画、插画等。学院还提供跨学科必修课程，涵盖传媒专业，使学生能够接触电影、摄影等领域。
多摩美术大学
多摩美术大学虽未单独开设动画专业，但其设计专业中包含动漫及插画教授，涵盖相关领域的研究。作为东京五美之一，多摩美术大学在视觉传达设计领域具有很高的声誉。
东京造形大学
东京造形大学是日本第一所以“造形”命名专攻设计与美术的小规模精英大学，培养具有创造性的高端艺术人才。该校在美术和设计领域具有很高的教育水平。
大阪艺术大学
大阪艺术大学是关西最大的艺术类专门院校，亚洲唯一作为海外加盟大学加入独立艺术与设计学院协会（AICAD）的艺术大学。学校定期出版自己的漫画杂志和文学杂志，拥有自己的电影节。
这些大学在动画专业方面都有各自的优势和特色，建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的大学进行深入研究。