南京江宁区内的高校排名如下：
东南大学
地址：江苏省南京市江宁区东南大学路2号
特点：国家双一流大学（A类）, 985, 211高校，创建于1902年，以上半年的建校历史，是享誉海内外的著名高等学府，校训为“止于至善”。
河海大学
地址：江苏省南京市江宁区
特点：双一流大学， 211高校，拥有百余年办学历史，以水利为特色，工科为主，多学科协调发展。
中国药科大学
地址：江苏省南京市江宁区佛城西路8号
特点：教育部直属，以药学为特色，理工经管文等多学科协调发展，国家“211工程”、“985工程优势学科创新平台”和“双一流”建设高校。
南京医科大学
地址：江苏省南京市江宁区天元东路818号
特点：由教育部、国家卫生和计划生育委员会、江苏省人民政府共建，是江苏省属重点建设大学，教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校。
南京工程学院
地址：江苏省南京市江宁区
特点：省属普通本科高校，坐落于历史文化名城南京。
金陵科技学院
地址：南京市江宁区弘景大道99号
特点：位于江宁区，未提供具体排名信息。
建议：
东南大学在江宁区的排名最高，作为国家双一流大学（A类）和985高校，其在教学和科研方面具有很高的声誉。
河海大学和中国药科大学也是江宁区内的重点高校，分别在水利和药学领域具有明显优势。
南京医科大学作为医学领域的重点高校，在培养卓越医生方面成果显著。
南京工程学院和金陵科技学院虽然规模较小，但在各自领域也有一定的影响力。