三本大学的来历可以归纳如下：
概念定义
三本大学，也称为独立本科，主要是指在一些高校扩招背景下设立的独立学院，这些学院大多数是民办院校。
三本院校是本科第三批次的简称，高考录取时分为不同批次，其中第三批主要是独立学院和民办院校。
历史背景
独立学院的概念诞生于1999年6月，是为了贯彻落实教育部八号文件精神，按照新的机制和模式举办的本科层次的二级学院。
三本院校从2000年开始出现，作为本科录取批次和录取顺序排在第三位置的学校。
发展变革
随着近几年改革，一些三本院校已经改名脱离原来的母体高校，成为独立的民办三本院校，开始独立办学。
同时，也有一些三本院校转为公办院校。
现状
虽然一些省份已经开始了本科批次的合并，本科三批已经取消，但独立学院与民办本科仍然存在，并且这些院校都是正正规规的由国家教育部批准的、合格毕业就发本科学历的正规大学。
社会认知
三本院校在社会上通常被认为是较普通的高等教育机构，但它们也是国家教育体系的一部分，颁发的学历证书和学位证书都是国家认可的。
综上所述，三本大学是随着我国高等教育扩招和改革而出现的，主要由独立学院和民办院校构成，它们在高考录取中属于第三批次，并且随着教育政策的调整，部分三本院校已经独立或转为公办。