南通大学的校训是“祈通中西，力求精进”。这一校训源自于清末著名实业家、教育家张謇先生为原南通大学医科、纺织科所题的训词，分别取自“祈通中西以宏慈善”和“忠实不欺力求精进”。
校训中的“祈通中西”强调在继承民族传统文化的基础上，广泛吸收和运用全人类先进文化成果，实现古今结合、中西融合的教育理念。“力求精进”则表达了学校师生应保持积极进取的精神状态，不断追求卓越，勇攀高峰。
这一校训不仅体现了张謇先生的教育思想，也承载了南通大学的文化积淀，激励着一代又一代的南通大学师生为实现中华民族的伟大复兴贡献力量