三本大学面临的困境主要包括以下几个方面：
就业竞争力弱：
三本大学生在就业市场上缺乏竞争力，甚至处于鄙视链的低端。由于企业普遍偏好985、211和双一流高校的毕业生，三本学历往往不被认可，面试机会也较少。与专科生相比，三本学生在专业技能和实践经验方面也较为欠缺，导致就业更加困难。
教育模式问题：
三本大学的教育模式过于理论化，缺乏实践性，不符合企业用工需求。这使得三本毕业生在就业市场上难以满足企业对于实际技能的需求。
学习氛围差：
三本大学的学习氛围普遍较差，学生普遍缺乏自我驱动力，很多学生进入大学后放松自己，不认真学习，也不积极实习积累经验，导致毕业时缺乏实际能力。
学历认可度低：
尽管三本大学也是国家承认的本科学历，但由于社会普遍存在的偏见，三本毕业生在求职过程中经常遭遇歧视，难以获得与一本、二本毕业生相同的待遇和机会。
招生困境：
三本大学在招生方面也面临困难，由于学费较高、品牌和美誉度不够等原因，导致生源质量较差，招生人数不足，一些学校甚至需要大幅度降分补录。
经济压力：
三本大学的学费和生活费用较高，给家庭带来较大经济压力，尤其是对于贫困家庭来说，高昂的学费成为许多学生选择放弃三本大学的重要原因。
改革和发展困难：
三本大学在教学、科研、管理等方面存在诸多改革难题，需要克服观念和利益分配等问题，同时面临经费不足等现实挑战。
综上所述，三本大学在就业、教育模式、学习氛围、学历认可度、招生、经济压力以及改革和发展等方面都面临着较为严重的困境。为了改善这一现状，三本大学需要从多方面进行改进，包括优化教育模式、提升教学质量、加强实践教学、改善学习氛围、提高学历认可度、合理控制学费等，以增强学生的就业竞争力和社会认可度。