民办大学确实 可以对违反规定的行为进行罚款。根据《规定》，民办高校出现以下行为的，由省级教育行政部门责令改正，并可给予1至3万元的罚款、减少招生计划或者暂停招生的处罚：
1. 学校资产不按期过户的；
2. 教育条件不达标的；
3. 发布未经备案的招生简章和广告的；
4. 年度检查不合格的。
此外，太原某民办学校因不按照规定提供服务而收取费用，被有关部门罚款10万元。
需要注意的是，虽然学校有权制定自己的规章制度，并对学生进行管理，但它们不能擅自对学生实施罚款。罚款是一种行政处罚手段，仅由拥有相应行政权力的行政机构或单位在特定情况下依法行使。学校对于违规违纪的学生，所能采取的惩罚措施应当限于给予学业警告以及开除学籍等处罚形式，而非罚款。
因此，民办大学在实施罚款前，必须确保其罚款行为符合相关法律法规的规定，否则可能面临法律责任。如果您认为民办大学存在违规罚款行为，可以向当地教育行政部门进行举报和投诉。