太原市位于小店区的三本大学有以下几所：
山西大学商务学院：
山西大学商务学院是山西省一所知名的独立学院，依托山西大学的优质教育资源，提供多个本科专业的教育服务。学院注重理论与实践的结合，致力于培养具有创新精神和实践能力的高级应用型人才。
太原理工大学现代科技学院：
太原理工大学现代科技学院是由太原理工大学与山西煤炭运销集团共同创办的独立学院。
中北大学信息商务学院：
中北大学信息商务学院是一所位于太原市的小三本大学，提供多个本科专业的教育服务。
山西医科大学晋祠学院：
山西医科大学晋祠学院是山西省一所三本大学，依托山西医科大学的优质教育资源，致力于培养医学领域的专业人才。
山西财经大学华商学院：
山西财经大学华商学院是山西省一所三本大学，依托山西财经大学的优质教育资源，提供多个本科专业的教育服务。
建议在选择三本大学时，可以综合考虑学校的教学质量、专业设置、就业前景等因素，以便选择最适合自己的学校。