长治市内的三本大学包括：
长治学院：
长治学院是一所综合性全日制普通本科院校，创建于1958年，前身为晋东南师范专科学校。2004年，长治学院经教育部批准升格为综合性全日制普通本科高校，并获得学士学位授予权。2012年起，长治学院与山西师范大学联合培养硕士研究生，2018年获批山西省省级硕士学位授予权立项建设单位。
长治医学院：
长治医学院是一所省属全日制普通高等医学院校，坐落于山西省长治市。学院创建于1946年，1986年升格为本科院校，更名为长治医学院。2004年，长治医学院通过本科教学工作水平评估。2011年，学院被国务院学位委员会批准为临床医学硕士专业学位研究生培养试点单位。2016年，长治医学院列入国家中西部高校基础能力建设工程。
建议：
长治学院和 长治医学院都是长治市内的三本大学，且长治医学院在医学领域具有较强的实力，建议优先考虑。
如果对医学专业不是特别感兴趣，长治学院也是一个不错的选择，综合性强，有多学科发展。