南京含金量高的二本大学包括以下几所：
南京工程学院：
以工程技术为主，是江苏省属工科型二本院校，近年来在工程学科方面成绩斐然。
南京晓庄学院：
以师范教育为特色，历史悠久，培养了众多优秀教师，是南京市民办教育的佼佼者。
南京信息工程大学：
国家级示范性软件学院，虽然为民办，但在信息技术领域享有很高的声誉。
南京审计大学：
独特的审计专业使其在民办大学中独树一帜，毕业生就业率一直保持高位。
南京邮电大学（应用科学学院）：
依托南京邮电大学的教育资源，培养了大批通信和信息科技人才。
南京林业大学：
以林科为特色，以资源环境类学科为优势的多科性大学，致力于培养具有生态文明理念和实践能力的高级专门人才。
南京工业大学：
以工科为主，化学工程与技术、材料科学与工程、生物工程等领域具有较强的学科实力。
南京财经大学：
在财经领域具有较高声誉，教学质量高，毕业生就业率稳定在较高水平。
南京中医药大学：
我国中医药领域的重要学府，医学、药学等专业在国内外享有较高声誉。
南京师范大学：
首批国家“211工程”重点建设高校、世界一流学科建设高校，也是中国高等师范教育的发祥地之一。
这些大学在各自的领域内有着较高的学术声誉和教学质量，涵盖了工程、财经、信息科技、林业等多个学科领域，为学生提供了广泛的专业选择。建议根据个人兴趣和职业规划，选择合适的大学和专业。