南京的二本最差大学包括以下几所：
南京工业大学浦江学院（中外合作办学）
常州工学院
南京师范大学中北学院
常州大学怀德学院
南京邮电大学通达学院
苏州大学应用技术学院
苏州大学应用技术学院（中外合作办学）
南京传媒学院
三江学院
南京航空航天大学金城学院
南京理工大学紫金学院
南京审计大学金审学院
东南大学成贤学院
南京工业职业技术大学
南京艺术学院
江苏第二师范学院
金陵科技学院（中外合作办学）
这些排名可能会根据不同的评价标准和数据有所变化，以上信息仅供参考。建议在选择学校时，可以综合考虑学校的教学质量、专业设置、就业情况等多方面因素。