石河子大学的校训是 明德正行 博学多能。
明德：
明，光明，明亮；德，道德、美德。明德，意在使美德发扬光大。语出《大学》：“大学之道，在明明德，在亲民，在止于至善”。
正行：
正，端正，符合标准；行，行为，行动；正行，意在使行为端正，举止符合礼仪规范。
博学：
博，丰富，通晓；学，学问，学识；博学，是指学问广博精深。语出《中庸》：“博学之，审问之，慎思之，明辨之，笃行之。”
多能：
多，很多，多种；能，能力，才能。多能，是指具有多方面才能。
校训“明德正行 博学多能”体现了石河子大学人在品德、行为、学识、才能方面的要求，主旨明确，内涵丰富，辞精义达，融古通今，文白兼有。