舟山目前有三所民办大学，分别是：
浙江海洋大学东海科学技术学院 主管部门：
浙江省教育厅
所在地：舟山市
办学层次：本科
备注：以浙江海洋大学为依托创建的民办普通本科院校，浙江省首批“加强应用型建设试点本科院校”。
浙江大学舟山校区 主管部门：
浙江大学与舟山市人民政府共建
所在地：舟山市
办学层次：本科
备注：浙江大学海洋学院，2012年共建，位于浙江舟山群岛新区长峙岛。
浙江国际海运职业技术学院 主管部门：
不详
所在地：舟山市临城新区
办学层次：高职（专科）
备注：由舟山航海学校（中专）、舟山电大、东海学院（民办）、定海职业技术学校等几所学校合并升格的高职院校。
建议：
浙江海洋大学东海科学技术学院是一所本科层次的民办大学，依托浙江海洋大学的资源，具有较高的教育质量和学术水平。
浙江大学舟山校区虽然是一所本科层次的院校，但它是由浙江大学与舟山市人民政府共建的，因此在教育资源和管理上可能会有独特的优势。
浙江国际海运职业技术学院则是一所高职（专科）院校，适合希望从事海洋相关职业的学生选择。