民办大学面临的困难主要包括以下几个方面：
教育质量参差不齐
民办高校往往缺乏统一且严苛的监管标准，导致教学质量不稳定。
部分民办高校为压缩成本，大量聘请兼职教师，这些教师流动性大，教学连贯性无法保障。
课程设置随意，重理论轻实践，专业课程未能契合社会需求，导致学生毕业后难以满足就业市场的需求。
高昂学费问题
民办大学的资金多源于民间资本注入，缺少财政补贴，因此办学成本转嫁到学生身上，学费远超普通公办院校数倍。
高昂的学费给家庭带来沉重负担，许多寒门学子因学费问题而放弃入学机会，教育公平受到挑战。
社会认可度低
就业市场上，企业招聘时往往偏好公办院校毕业生，民办学生投递简历常石沉大海。
考公、考研等环节，民办学生也易遭偏见，社会默认其教学、科研水平低，影响学生的自信心和发展机会。
教育资源分配不均
民办大学在获取教育资源（如实验室设备、图书馆藏书等）方面不如公办大学，限制了学生的实践能力和研究机会。
民办大学的教师没有编制，相当于员工，企业面临经济困难时，教师面临裁员风险，影响教学质量。
资金来源不稳定
民办大学的资金主要来源于学费和其他非政府资助，这种资金模式可能导致学校在经济上面临较大的波动风险。
生源不足时，民办大学的经费更加紧张，进一步影响教师的待遇和学校的运营。
管理不科学
民办大学的管理普遍比较严格，但同时也存在管理不科学的问题，如产权不明晰、管理不透明等。
部分民办高校在追求经济效益的同时，可能忽视了教育质量和学生发展，导致整体声誉受损。
政策和监管环境
民办大学在法律和监管方面的不确定性可能会影响学校的长期规划和发展。
尽管中国政府对民办教育给予了政策上的支持，但在实际操作中，民办大学可能无法享受到与公办大学同等的优惠政策。
综上所述，民办大学在教育质量、学费负担、社会认可度、教育资源分配、资金来源、管理科学性和政策环境等方面都面临着较大的挑战。为了提升民办大学的整体水平和发展前景，需要从多方面进行改进和优化。