上海交通大学医学院和复旦大学上海医学院都是国内顶尖的医学院校，具有深厚的历史底蕴和强大的学术实力。以下是它们的一些比较：
历史沿革
复旦大学上海医学院：创建于1927年，前身为国立第四中山大学医学院，后经历了多次更名，如国立上海医学院、上海第一医学院、上海医科大学等。2000年，复旦大学和上海医科大学合并，上海医科大学成为复旦大学的一个二级学院。2012年，成立了上海医学院，成为复旦大学的一个派出机构。
上海交通大学医学院：前身为圣约翰大学医学院、震旦大学医学院、同德医学院，于1952年全国高等学校院系调整时合并而成上海第二医学院。2005年，上海交通大学和上海第二医科大学合并，上海第二医科大学成为上海交通大学的一个二级学院。
学科实力和博士点
复旦大学上海医学院：有10个一级学科硕士点、9个一级学科博士点，7名中国科学院院士和4名中国工程院院士。它有4个双一流学科和5个国家二级重点学科。
上海交通大学医学院：有9个一级学科硕士点、9个一级学科博士点，6名中国科学院院士和15名中国工程院院士。它有4个双一流学科和9个上海高校一流学科。
附属医院
复旦大学上海医学院：拥有17所附属医院，包括中山医院、华山医院等。
上海交通大学医学院：有13所附属医院，包括瑞金医院、仁济医院等。
招生和考试
博士招生：上海交通大学医学院2025年博士招生报名时间为2024年10月20日—12月15日，预计招生人数为800人左右。复旦大学上海医学院2025年博士招生报名时间为2024年12月1日—12月30日。两所学院都将统一安排英语笔试，时间为2025年3月8日。
教学资源和科研实力
复旦大学上海医学院：在医学教育方面具有悠久的历史，教育模式与国际接轨，注重基础与临床的结合。学院拥有多家一流的医疗机构作为临床教学基地。
上海交通大学医学院：以优越的教学资源和科研实力成为中国医学教育的领军者，尤其在基因编辑、癌症研究、干细胞技术等前沿医学领域取得了显著成果。学院还积极推动国际化发展，与世界多所知名大学和医学机构建立了合作关系。
建议
学术实力：从学科实力和博士点数量上看，复旦大学上海医学院在顶尖学科方面略占优势，而上海交通大学医学院在整体学科实力上稍胜一筹。
附属医院：两所学院都拥有众多一流的附属医院，为学生的临床实习提供了良好的条件。
个人兴趣和职业规划：考生可以根据自己的兴趣和职业规划来选择适合的医学院校。如果希望在医学领域进行前沿研究，上海交通大学医学院可能更合适；如果希望获得更全面的医学教育和临床实习机会，复旦大学上海医学院可能更适合。
综合考虑，两所医学院校都是国内顶尖的医学教育机构，选择哪一所取决于个人的具体需求和偏好。