三本大学与独立学院 存在明显差异，主要体现在以下几个方面：
办学主体与性质
三本大学：通常是指公办民助范畴的大学，它们是由政府投资兴建并运营管理，拥有国家授权的学位授予权限，属于公立学校。
独立学院：是由企业、事业单位、社会团体、个人等非政府部门独立设立的高等教育机构，没有学位授予权限，属于私立学校，由民间资本投资兴建并运营管理。
办学层次与学历证书
三本大学：提供本科学历教育，学生毕业后可获得国家承认的本科毕业证书和学士学位证书。
独立学院：也提供本科学历教育，但毕业证书上加盖的是合作大学的印章，而不是学校校名的印章。
教学质量与学费
三本大学：通常拥有较为优秀的师资力量、教学设施和教学科研水平，学费相对较高。
独立学院：教学质量参差不齐，但学费相对较低，吸引了许多低分学生报考。
招生政策
三本大学：招生政策相对固定，一般需要考生通过高考或其他考试获得录取资格。
独立学院：可以自主招生，也可以通过高考等方式招收学生。
转设情况
独立学院：根据教育部政策，独立学院必须全部完成转设，部分转设为不再依靠母体的民办高校，部分成功发展为公办本科大学。
建议
对于考生：在选择三本大学还是独立学院时，应重点考虑自己的学术目标和家庭经济情况。如果追求更高的教学质量和学位认可度，三本大学可能是更好的选择。如果注重较低的学费和灵活的招生政策，独立学院也是一个可以考虑的选项。
对于独立学院：随着教育部政策的推动，独立学院正逐步完成转设，未来可能会有更多的独立学院发展成为公办本科大学，因此，选择独立学院时，可以关注其转设进展和母体高校的支持情况。
希望以上信息对你有所帮助。