原来的三本公办大学包括以下几所：
1. 华中科技大学武昌分校
2. 浙江大学城市学院
3. 文华学院
4. 吉林大学珠海学院
5. 四川大学锦江学院
6. 云南师范大学商学院
7. 燕山大学里仁学院
8. 武汉科技大学城市学院
9. 北京师范大学珠海分校
10. 河南理工大学万方科技学院
11. 天津商学院宝德学院
12. 天津师范大学津沽学院
13. 南开大学滨海学院
14. 天津外语学院滨海外事学院
15. 河北大学工商学院
16. 石家庄经济学院华信学院
17. 山西医科大学晋祠学院
18. 山西财经大学华商学院
19. 中北大学信息商务学院
20. 太原科技大学华科学院
21. 中国医科大学临床医药学院
22. 南京审计学院金审学院
23. 天津医科大学临床医学院
24. 武昌首义学院
25. 江西财经大学现代经济管理学院
26. 上海杉达学院
27. 上海外国语大学贤达经济人文学院
28. 西南财经大学天府学院
29. 河北医科大学临床学院
30. 厦门大学嘉庚学院
31. 西安建筑科技大学华清学院
32. 北京大学
33. 清华大学
34. 中国人民大学
35. 对外经济贸易大学
36. 上海交通大学
37. 复旦大学
38. 同济大学
39. 华东理工大学
40. 浙江大学
41. 南京大学
42. 东南大学
43. 中国科学技术大学
44. 武汉大学
45. 中南大学
46. 湖南大学
47. 西安交通大学
48. 西北工业大学
49. 重庆大学
50. 中国石油大学（北京､华东､华北､华南四个校区）
51. 东北石油大学
52. 中国矿业大学（北京､徐州两个校区）
53. 兰州交通大学
54. 泰山医学院
这些学校在当时被认为是三本大学，但请注意，随着时间的推移和高等教育体系的改革，一些学校可能已经提升了其办学层次。在选择学校时，建议查看最新的官方信息和学校官方网站以获取最准确的资料。