三本大学学费贵的原因主要有以下几点：
国家拨款少：
三本大学多为民办或独立学院，国家几乎没有拨款，学校需要自己承担运营和教师工资等费用，因此学费较高。
资金来源有限：
三本大学的资金来源相对有限，主要依靠学费来弥补运营和发展所需的资金。
教育质量和资源投入：
为了提供良好的教学和研究环境，三本大学需要投入较多的教育资源，包括实验室设备、图书资料、教师培训等，这些投入会增加学校的运营成本，从而导致学费相对较高。
市场需求和竞争压力：
随着高等教育市场的竞争日益激烈，三本大学需要不断提升教学质量和学生就业竞争力，为此需要投入更多的资源和资金，这也是导致学费偏高的一个原因。
商业性经营模式：
三本大学多采用商业性经营模式，学校的主要收入来源是学费，这使得学费相对较高。
建设和条件：
三本大学的建设条件通常较好，如宿舍、教学设施等，这些都需要大量的经济支持，因此学费也相应较高。
教育投资支出不足：
教育投资经费的缺乏直接影响了三本大学的教学、科研、师资和设施建设水平，学校只能通过提高学费来改善教育环境和教学质量。
综上所述，三本大学学费贵主要是由于其民办或独立学院的性质、国家拨款少、资金来源有限、教育质量和资源投入需求高、市场竞争激烈以及商业性经营模式等多方面因素共同作用的结果。