三本大学申请日本大学需要满足一定的条件，以下是一些基本的申请要求和建议：
学历要求
完成12年的正规学校教育或同等学历。
日语能力
建议至少达到N2及以上水平。
对于研究生（硕士预科）申请，可能需要J-TEST EF级或日语能力考试四级以上，并且有15160小时以上的日语学习经历。
学术成绩
尽管三本大学的背景可能不占优势，但通过努力学习和准备，仍有机会申请到日本的知名大学。
需要有较好的在校成绩和研究计划书写作能力。
经济能力
需要有能力支付留学费用，并且对留学有坚定的决心和明确的留学目标。
申请流程
可以选择通过语言学校过渡，再申请大学。
也可以直接申请日本的研究生（硕士预科），之后参加大学院修士入学考试。
推荐信和文书
准备一份出色的个人陈述和推荐信，突出自己的优势和特长。
研究计划书也是关键，需要扎实的专业课基础和研究能力。
具体大学申请
除了顶尖的国公立大学，也可以考虑申请地方性国立大学或知名度较高的私立大学。
建议
提前规划：尽早开始准备，包括语言学习和研究计划书的撰写。
选择合适的大学和专业：根据自己的兴趣和职业规划，选择合适的大学和研究生课程。
注重文书准备：文书是申请过程中非常重要的一环，需要精心准备，突出自己的优势。
寻求帮助：可以考虑找专业的留学机构或中介协助申请，以节省时间和精力。
通过以上准备，三本大学的学生也有机会成功申请到日本的知名大学。