民办大学股权的变更涉及一系列的程序和注意事项，以下是一些关键步骤和要点：
股权转让协议
股权转让双方应签订书面协议，明确转让的条款和条件，包括转让价款、支付方式、保证、债权债务分担、费用负担、违约责任、合同变更和解除等。
协议中应明确股权变更后的出资比例，以及转让方和受让方的权利和义务。
纳税申报与登记
转让方为纳税义务人，受让方是扣缴义务人，需履行代扣代缴税款的义务。
股权转让交易完成后，转让方或受让方应到主管税务机关办理纳税申报，并持税务机关开具的完税凭证或免税、不征税证明，到工商行政管理部门办理股权变更登记手续。
内部决策程序
民办学校的理事会、董事会或其他决策机构需召开会议，讨论并决定股权转让事宜，特别是变更举办者等重大事项，需经2/3以上组成人员同意方可通过。
变更登记手续
办理股权变更登记时，企业需填写《个人股东变动情况报告表》并向主管税务机关申报。
变更登记所需材料包括变更登记申请表、营业执照、公司章程修正案、股东会决议、股权转让协议等。
相关手续
股权转让过程中，转让方需协助受让方办理与股权转让相关的法律手续，包括办学许可证变更手续、工商变更登记手续等。
受让方需按照中国法律法规的规定，办理相关的审批手续。
保证与承诺
转让方应保证其持有的股权不存在任何权利瑕疵，如抵押、质押、担保等权利限制。
优先购买权
股东向股东以外的人转让股权时，其他股东在同等条件下享有优先购买权。若两个以上股东主张行使优先购买权，应协商确定各自的购买比例；协商不成时，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。
费用负担
股权转让过程中产生的费用，包括税费、中介费等，应由转让方和受让方根据协议约定分担。
通过以上步骤和注意事项，可以确保民办大学股权变更的合法性和有效性。建议在实际操作中，各方应充分沟通、明确各自的权利和义务，并严格按照相关法律法规和协议条款执行。