挂科率最高的二本大学排名如下：
1. 中国科学技术大学，挂科指数为99.06%。
2. 南京理工大学，挂科指数为98.45%。
3. 武汉大学，挂科指数为98.09%。
4. 东北师范大学，挂科指数为97.34%。
5. 西南大学，挂科指数为96.59%。
6. 华中农业大学，挂科指数为96.44%。
7. 厦门大学，挂科指数为96.36%。
8. 中南财经政法大学，挂科指数为96.25%。
9. 北京航空航天大学，挂科指数为95.41%。
10. 上海外国语大学，挂科指数为95.23%。
建议：
如果你打算申请这些学校，建议提前了解并准备好，因为这些学校的挂科率较高，意味着学生需要付出更多的努力才能顺利毕业。