三本大学的办学性质主要区别如下：
办学性质
一本大学主要由公立高校提供，而二本大学大多数也是公立的，但也包括少数民办院校。三本大学则主要涵盖独立学院本科、部分民办高校、中外合作办学的专业，以及一些专科升本科或艺术体育类专业。这些院校可能既有公办民助，也有私企或私人办学。
等级与性质
一本大学和二本大学都属于公办本科，而三本大学则属于民办院校。三本大学带有浓厚的民办性质，与公办本科存在较大差距。
学费标准
一本和二本院校的学费标准较低，每年每生学费约5000元左右，而三本院校的学费标准较高，一般在一万元以上，有的甚至达到三万多元，主要依靠学生的学费来支撑。
文凭与认可度
一本、二本和三本院校的毕业证书和学位证书都是国家承认的。虽然社会对三本院校的认可度相对较低，但在求职过程中，三本院校的学生也具备一定的竞争力，尤其是在一些注重实践能力的岗位上。
办学范畴
一本和二本院校的范畴主要是公办本科，而三本院校一般是独立学院本科院校，属于公办民助范畴。
教育资源与管理
一本和二本院校通常教育资源雄厚，管理上实施相对独立的教学组织和管理，有独立的校园和办学设施。三本院校在管理上可能相对较弱，但也在努力提高教育质量。
综上所述，三本大学与一本和二本大学在办学性质、等级、学费、文凭认可度、办学范畴以及教育资源和管理方面存在明显的区别。考生在选择高校时，可以根据自己的兴趣、职业规划以及家庭经济情况来综合考虑。