齐齐哈尔市的三本大学包括：
黑龙江东方学院
黑龙江财经学院
黑龙江外国语学院
东北农业大学成栋学院
哈尔滨石油学院
齐齐哈尔工程学院
黑龙江工程学院昆仑旅游学院
哈尔滨华德学院
齐齐哈尔大学
齐齐哈尔医学院
齐齐哈尔高等师范专科学校
齐齐哈尔理工职业学院
建议：
齐齐哈尔大学是黑龙江省西部地区唯一一所省属综合性普通高等学校，也是黑龙江省属三所综合性大学之一，具有较高的教学水平和研究实力，建议优先考虑。
齐齐哈尔工程学院和 齐齐哈尔医学院也是齐齐哈尔市较为知名的三本院校，分别侧重于工程和医学领域，可以根据个人兴趣和职业规划进行选择。