三本大学的办学历史可以追溯到1999年，当时为了贯彻落实教育部八号文件精神，按照新的机制和模式举办了本科层次的教育。这些学校被称为“三本”院校，与一本和二本院校有所区别。然而，三本院校的地位在2014年发生了变化，国务院提出要创造条件逐步取消普通高等学校招生录取批次，原本的三本学校逐步取消，并调整到本科二批招生。到了2020年，教育部更是宣布全部取消三本院校，一本和二本进行合并，三本院校的时代正式终结。
尽管三本院校已经退出历史舞台，但仍有部分三本大学在各自的领域取得了显著成就。例如，湘南学院是一所建校历史较长的三本大学。此外，在医学类三本大学方面，天津医科大学临床医学院、河北医科大学临床学院和长沙医学院等是其中的佼佼者。这些学院依托母体高校的教育教学资源，积极探索适应社会需求的办学体制，并已经建立了较为完善的临床教学基地，为学生提供了良好的实践教学场所。
总的来说，三本大学在我国的办学历史虽然相对较短，但它们在特定时期为教育事业做出了贡献，并为社会培养了大量专业人才。如今，随着教育改革的不断深入，三本院校已经完成了其历史使命，一本和二本院校的合并将成为未来高等教育的主流趋势。