昆山文科二本大学包括：
昆山杜克大学：
这是一所由美国杜克大学和中国武汉大学合作创办的非营利性中美合办高校，提供本科和研究生课程。虽然它是一所高水平的中外合办大学，但在江苏省内，它可能被视为一所二本大学。
南京大学金陵学院：
这所学院是南京大学的一个二级学院，提供多个本科专业及专业方向。虽然南京大学是一所211和985高校，但其二级学院在江苏省内的招生可能被视为二本。
南京中医药大学翰林学院：
这所学院是南京中医药大学的一个二级学院，涵盖文、理、工、管、法、教育等学科。南京中医药大学作为一所本科高校，其二级学院在江苏省内的招生也可能被视为二本。
苏州大学应用技术学院：
该学院成立于1997年，提供34个本科专业及专业方向。作为苏州大学的二级学院，它在江苏省内的招生可能被视为二本。
昆山文理学院：
这所学院涵盖文、理、工、管、法、教育等学科，可能提供文科相关的本科专业，因此在江苏省内的招生可能被视为二本。
昆山科技大学：
虽然以工科为主，但它也涵盖文、理、工、管、法、教育等学科，是一所应用型本科高校。在江苏省内，它的招生可能被视为二本。
建议您根据最新的招生政策和投档情况来确认这些院校的招生层次，因为每年的招生情况可能会有所不同。