一本线上40分的理科生可以考虑报考以下国内著名的高水平大学：
清华大学：
清华大学在国内外享有很高的声誉，在理科领域也有很强的研究实力和招生。
北京大学：
北京大学同样在国内理科教育领域有很高的知名度和声誉，对考生的分数线要求相对较低。
复旦大学：
复旦大学在国内理科教育领域也有很高的知名度和声誉，对考生的分数线要求相对较低。
上海交通大学：
上海交通大学在国内理科教育领域和科研领域都有很高的知名度和声誉，招生也相对稳定。
建议考生根据当地一本线的分数线和自身的分数情况，综合考虑这些大学的录取可能性，选择最适合自己的学校和专业。