新疆的三本大学中，新疆大学科学技术学院已经成功转型为新疆理工学院，成为了一所公办二本院校。新疆理工学院是由新疆大学与阿克苏地区合作举办的，先设立阿克苏校区，后申请转制为公办二本院校，并于2019年6月获得教育部的正式批准。
此外，新疆财经大学商务学院也进行了更名升格公示，预计将转为公办二本招生，学费也将从之前的1.2万元下调到现在的4000元一学年。
因此，新疆的三本大学中，新疆大学科学技术学院和新疆财经大学商务学院都有望升为二本学校。建议关注相关官方公告和教育部的进一步通知，以获取最新和准确的信息。