大学划分中的三本和二本主要存在以下区别：
录取批次
二本为本科第二批次录取，三本为本科第三批次录取。
学费
三本院校的学费相对较高，一般高于二本院校。三本院校包括独立学院和民办高校，这些学校的学费通常较高。
办学水平
二本院校的办学水平相对较高，通常拥有较为完善的教学设施和较强的师资队伍。三本院校的办学水平相对较低，多数为独立学院或民办学校，可能在教学设施、师资力量等方面与二本院校存在差距。
社会认可度
虽然一本、二本、三本在本质上都是普通本科层次的高校，证书相同，但社会对三本的认可度通常较低。一本院校由于是国家重点扶持，社会认可度最高。
教学环境
二本院校的教学环境通常较为完善，校园规模较大，设施较为先进。三本院校的教学环境相对较差，设施可能不够齐全，校园规模也可能较小。
教师队伍
二本院校的教师队伍通常较强，具备较高的教学和研究能力。三本院校的教师队伍相对较弱，研究能力几乎为零。
招生政策
一本院校通常面向全国招生，录取竞争激烈。二本院校部分面向全国招生，部分在本省招生。三本院校主要面向省内招生，录取门槛相对较低。
毕业证书
一本、二本、三本院校的毕业证书在样式上基本相同，均不标明批次，只表明是本科，但三本院校的毕业证书上可能会注明“独立学院”或“民办高校”等字样。
需要注意的是，随着教育改革的深入，一些省份已经将二本和三本合并，统称为本科第二批次，不再区分一本、二本和三本。合并后，这些高校的毕业证书、毕业待遇、考研、考公务员等方面均享受同等待遇。