根据提供的信息，教育部并没有专门针对分子物理专业进行排名，而是将分子物理作为物理学类的一个方向来考虑。排名会根据不同学校的师资、科研、教学水平等因素而有所不同。以下是一些在物理学学科中表现突出的大学，它们在原子与分子物理领域也具有较强的教学和研究能力：
1. 北京大学
2. 中国科学技术大学
3. 清华大学
4. 复旦大学
5. 上海交通大学
6. 南京大学
7. 南开大学
8. 吉林大学
9. 浙江大学
10. 武汉大学
这些排名信息可以作为参考，但请注意，具体排名可能会随着时间和各种评价标准的变化而有所调整。建议在选择学校时，还需查看最新的排名信息，并结合自己的兴趣和目标进行综合考虑。